Медленные запросы – частая проблема. Используйте EXPLAIN для анализа.

• Создавайте индексы на часто используемые столбцы.
• Избегайте SELECT *, перечисляйте нужные столбцы.
• Используйте JOIN вместо подзапросов, где это возможно.
• Ограничивайте количество строк с LIMIT.
• Проверяйте планы выполнения и настраивайте параметры сервера.